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科学研究

生物医学信息与工程学院李永生教授团队揭示MIR22HG在结肠癌中的调控

编辑:kjc 阅读量: 更新时间:2020-10-27


结直肠癌(Colorectal Cancer, CRC)是常见的消化道恶性肿瘤。越来越多的研究表明长链非编码RNA(Long Noncoding RNAs, lncRNAs)在人类多种癌症中出现失调,在恶性肿瘤的发生发展过程中发挥重要的作用。然而,在结肠癌中lncRNA的表达情况还没有被系统刻画,我们对于lncRNA在结肠癌中的功能了解还是有限的。

近日,球探比分生物医学信息与工程学院李永生教授团队与上海中医药大学张继伟教授团队对结肠癌中lncRNA的表达系统刻画,并识别了关键免疫相关调控因子MIR22HG,通过计算和实验结合解析了其在结肠癌中的免疫调控机制。该研究成果于202034日发表于国际知名期刊Molecular Cell(影响因子15.302,中科院1区),李永生教授,张继伟教授为论文的共同通讯作者。

在国家自然科学基金及热带转化医学教育部重点实验室的支持下,团队通过生物信息学分析了近700例结肠癌患者的转录组,借助于文本挖掘等技术识别了候选lncRNA分子-MIR22HG。该lncRNA在结肠癌患者中显著下调,其基因组区域发生了明显的拷贝数缺失,MIR22HG低表达与病人差的预后相关。通过细胞、动物等试验手段,团队发现MIR22HG的下调能够促进肿瘤细胞的生长、增殖及转移。进一步分析发现MIR22HG主要是通过与SMAD2结合,进而影响了SMAD2-SMAD4的互作强度,进一步激活了下游SNAI1的活性,诱导上皮-间质转化。

免疫治疗是当前癌症研究的热点问题,通过结合本团队开发的计算学方法ImmLnc,发现MIR22HG的表达在结肠癌中与突变负荷、MHC得分、Immune得分及CYT得分显著相关,暗示其在免疫调控中的关键作用。通过进一步计算分析及实验验证,团队发现MIR22HG能够促进细胞内CD8 T细胞的含量,通过注射MIR22HGPDL1的抑制剂能够有效的对肿瘤细胞进行抑制作用,表明MIR22HG+PDL1抑制剂在结肠癌中的组合治疗方式。

结肠癌中MIR22HG的调控作用方式图

论文链接:https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-020-01174-w